Comuna Pardina este amplasată în nord – vestul județului Tulcea, în perimetrul Deltei Dunării, fiind delimitată la nord de brațul
Chilia (frontiera cu Ucraina); la est de teritoriul administrativ al comunei Chilia Veche; la sud de teritoriul administrativ al
comunei Maliuc şi al comunei Crişan şi la vest de teritoriul administrativ al comunei Ceatalchioi şi al oraşului Tulcea.
Localitatea Pardina se întinde pe o lungime de 7 km pe brațul Chilia şi este poziționată la o distanța de 42 km de municipiul Tulcea.