Comuna Niculițel este situată în zona de nord-vest a județului Tulcea şi este delimitată de următoarele teritorii comunale: la nord de teritoriul administrativ al oraşului Isaccea, la vest de teritoriul administrativ al comunei Hamcearca, la sud de teritoriul administrativ al comunei Izvoarele şi la est de teritoriul administrativ al comunei Somova şi al comunei Frecatei.